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劍橋大學(xué) | DNA測序方法揭開基因組黑匣子的“面紗”
指南者留學(xué) 2023-01-25 10:24:45 閱讀量:1148
<p>在《自然生物技術(shù)》雜志上發(fā)表的一篇論文中,劍橋大學(xué)的研究人員概述了一種新的DNA測序方法,可以檢測小分子藥物在哪里以及如何與目標(biāo)基因組相互作用。</p> <p>&nbsp;</p> <p>&ldquo;了解藥物在體內(nèi)的作用機(jī)制對于創(chuàng)造更好、更有效的療法至關(guān)重要,&rdquo;該研究的共同第一作者、優(yōu)素福&middot;哈米德化學(xué)系的余祖濤博士說。&ldquo;但當(dāng)一種治療藥物進(jìn)入一個擁有30億個堿基的基因組的癌細(xì)胞時,就像進(jìn)入了一個黑盒子。&rdquo;</p> <p>&nbsp;</p> <p>這種被稱為化學(xué)圖譜的強(qiáng)大方法,通過使研究人員能夠檢測小分子藥物在DNA基因組上與靶標(biāo)相互作用的位置,揭開了這個基因組黑盒子的面紗。</p> <p>&nbsp;</p> <p>每年,數(shù)百萬癌癥患者接受基因組靶向藥物治療,如阿霉素。但是,盡管經(jīng)過了幾十年的臨床應(yīng)用和研究,基因組的分子作用模式仍然沒有得到很好的理解。</p> <p>&nbsp;</p> <p>&ldquo;許多救命藥物直接與DNA相互作用來治療癌癥等疾病,&rdquo;共同第一作者約亨&middot;斯皮格爾博士說。&ldquo;我們的新方法可以精確地繪制藥物與基因組結(jié)合的位置,這將有助于我們在未來開發(fā)更好的藥物。&rdquo;</p> <p>&nbsp;</p> <p>化學(xué)圖譜允許研究人員使用一種稱為小分子定向轉(zhuǎn)座酶Tn5修飾的策略,以前所未有的精度對小分子-基因組相互作用進(jìn)行原位定位。該方法檢測基因組中小分子與基因組DNA或DNA相關(guān)蛋白質(zhì)結(jié)合的結(jié)合位點(diǎn)。</p> <p>&nbsp;</p> <p>在這項(xiàng)研究中,研究人員使用化學(xué)圖譜來確定廣泛使用的抗癌藥物阿霉素在人類白血病細(xì)胞中的直接結(jié)合位點(diǎn)。該技術(shù)還表明,在已經(jīng)暴露于組蛋白去乙?;?HDAC)抑制劑tucidinostat的細(xì)胞上使用阿霉素的聯(lián)合治療可能具有潛在的臨床優(yōu)勢。</p> <p>&nbsp;</p> <p>該技術(shù)還被用于繪制某些分子在DNA g -四重鏈(即G4s)上的結(jié)合位點(diǎn)。G4s是與基因調(diào)控有關(guān)的四鏈二級結(jié)構(gòu),可能成為未來抗癌治療的靶點(diǎn)。</p> <p>&nbsp;</p> <p>他說:&ldquo;我為我們能夠解決這個長期存在的問題而感到自豪&mdash;&mdash;我們已經(jīng)建立了一種高效的方法,這將為新的研究開辟許多道路。&rdquo;</p> <p>&nbsp;</p> <p>領(lǐng)導(dǎo)這項(xiàng)研究的尚卡爾&middot;巴拉蘇布拉曼尼亞教授爵士說:&ldquo;化學(xué)圖譜是一種強(qiáng)大的新方法,可以檢測基因組中小分子與DNA或DNA相關(guān)蛋白質(zhì)結(jié)合的位置。&rdquo;它為一些藥物療法如何與人類基因組相互作用提供了巨大的見解,并使開發(fā)更有效、更安全的藥物療法變得更容易。&rdquo;</p> <p>&nbsp;</p> <p>參考:</p> <p><br />于祖濤,Jochen Spiegel等。化學(xué)圖譜分析了細(xì)胞內(nèi)藥物與染色質(zhì)的結(jié)合自然生物技術(shù)(2023)。DOI: 10.1038 / s41587 - 022 - 01636 - 0</p> <p>&nbsp;</p> <blockquote> <p>注:本文由院校官方新聞直譯,僅供參考,不代表指南者留學(xué)態(tài)度觀點(diǎn)。</p> </blockquote>
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